本书主要讲了人类与自然的区别与关系，人类的起源，人类的文明，人类的科学。主题有环境保护、古迹保护、生命的作用和意义、科学精神。
人类真正的光荣是科学。科学是什么？科学应当是对自然事物的客观反映，而不应该是自然的主宰，我们不能说：“自然正在按照科学的定律运行着。”科学禁止了人对科学以外的东西的认知。如果科学走向恒定，把科学以外的东西称作伪科学，强迫自然符合科学，见到不符合的就闭上眼睛，装作没看见，那么科学也要成为迷信。
科学发明的动机是什么？无论科学技术多么发达，我们都不能否定，现在是我们发明机器的动机与原始人发明石器的动机并没有什么两样的，都是用来满足人类不断膨胀的享受欲望。因此，人类的文明对自然造成了破坏，科学技术越发达，破坏越严重。这种文明本身并不是要毁灭地球，它本应在人类的理性控制之下。但正如爱因斯坦所说：“除了我们的思维方式以外，一切都改变了。”人类把地球当成了自己的私有财产，成了地球的统治者。
我曾经看过一本书，叫做《人类曾经被毁灭》（听说已经遭禁，为什么不容假说呢？里面的例子有许多都是被封锁的，就是闭上眼睛。），整本书根据无数的例子、古代世界到处都相同的神话和科学的数据证明了下面这个科学假说：中国天神话中的“天”、甲骨文中的“天”与现在的天根本不是一回事。那是一个有形有体的天——它就是现在天空中的月亮。大约在15000多年以前，一艘来自宇宙深处的外星人飞船——月球宇宙飞船驶进了太阳系，并降临地球近地轨道，悬浮在中国西北地区的上空，低得仿佛一踮脚就可以摸得着，传说中的神降临了地球。月球宇宙飞船上的高级生物降临地球后，利用地球动物基因，通过剪切、拼接、重组，创造了人类。之后还教育了人类，有了人类的第一代文明。《周易》、中医、金字塔都是这一代文明的遗留物。由于当时人的理解能力还不完善，所以高级生物只教给了方法，没有讲原理，这就造成我们现在对中医的原理一无所知。后来月球飞船中爆发了骇人听闻的战争。被击伤的月球宇宙飞船被迫飞离地球，“天”与地发生分离，诱发了滔天的大洪水，吞没了平原、谷地上的一切生灵。侥幸活下来的高山牧羊人没有能力把第一代文明继承下来，而是发展起我们今天的物质文明。
在《圣经》当中，当上帝知道了夏娃带领亚当偷吃了“知善恶果”后，十分震怒，他说：“那人已经与我们相似，能知善恶，现在恐怕他伸手又摘生命树上的果子吃，就永远活着。”于是，上帝将他俩赶出了伊甸园。“知善恶果”在这里代表一种知识、一种文明。不同的文明对善恶的看法相去甚远，大洪水前文明的善恶标准肯定与今天物质文明的有所差别。上帝就是告诫后人应当延续大洪水前的文明模式，否则，人类社会将要遭遇意料之外的困难。本来，人们以为上帝自私，不让人类发展如此好的物质文明：动物被驾奴了，沼泽被疏干了，江河被防治了，森林被开发了，荒原被耕种了，时间被计算出来了，空间被测量出来了，天体运行被识破了，海洋被横渡了，高山被跨越了，世界各地都被打上了人力的印记。但是近年来，环境保护的广泛开展，掀起了对于发展物质文明的反思。另外，西方的科学主张“还原论”，即杯子由陶瓷做成，里面有分子，分子里有原子……而人原来都是具有“整体论”的思维模式的。但是，随着科学技术的发展，“还原论”出现了许多弊端，许多学科已经开始向“整体论”转化。人转了一个大圈，最后回到了当初的起点。看来上帝是够英明的，在人类初期，他了解物质文明将给人带来的困难。
这个文明的转化目前人类是没有资格的。人类离取消“征服自然”的口号还需要时间。但是，人必须对自然界保持基本的尊敬，否则，就难保人类的生存和发展。幸好，人类仅仅处于文明发展史的黎明时期，离太阳变冷还有十几万年光景，我们不必期望过高。文明的等级越高，歧视就越少。原先的奴隶、奴隶主阶级歧视已经消亡，国籍、肤色、种族歧视已经逐渐消亡。当人之间的歧视消灭完成后，剩下的是逐步消除物种歧视。对实验用动物是物种歧视的一部分，终有一天，我们的后代在回顾20世纪我们在实验室的所作所为时，将感到恐怖与不可思议，正如我们现在回顾古罗马竞技场中的屠杀于18世纪的奴隶贩卖时赶到恐怖与不可思议一样。随着歧视的消亡，人类的文明一定会改变。依照现在的观点，若消除物种歧视，那么难道不可以吃生物、踩死生物、消灭微生物吗？自然界原是弱肉强食，人类的文明抵抗它并逐步地从同阶级推广到全人类。再要推广，难道教猫不吃老鼠？所以说，用现在的观点看，消除物种歧视、弱肉强食是不可能、不应该的。
尽管如此，我们仍然有必要知道，如果人的价值只在于掠夺来满足自己的欲望，那么人类与自然界的其他动物就没有区别。我们今天的探索决不是为了沉浸在辉煌之中，而是为了明天的道路更宽广。科学的尴尬正面对上帝的嘲笑，源于环境的压力，改造、占有物质资料的道路已经受到了反思和怀疑，人类转了几千年的科学圈子，又回到了当初的起点。
