药师法门以读诵《药师琉璃光如来本愿功德经》，念药师咒，念南无药师琉璃光如来名号为根本，法门殊胜。修药师法门的人切记多多帮助病苦的人，多多施药关心病人，如经所说而行。如法修持，获福无边。
药师琉璃光如来本愿功德经
唐三藏法师玄奘奉 诏译
南无药师海会佛菩萨(三称)
香赞：
炉香乍热 法界蒙熏 诸佛海会悉遥闻 随处结祥云 诚意方殷 诸佛现全身
南无香云盖菩萨摩诃萨 (三称)
南无本师释迦牟尼佛(三称)
开经偈：
无上甚深微妙法 百千万劫难遭遇 我今见闻得受持 愿解如来真实义
药师琉璃光如来本愿功德经
唐三藏法师玄奘奉 诏译
如是我闻：一时薄伽梵，游化诸国，至广严城，住乐音树下。与大比丘众八千人俱，菩萨摩诃萨三万六千，及国王、大臣，婆罗门、居士，天龙八部，人非人等，无量大众，恭敬围绕，而为说法。
尔时、曼殊室利法王子，承佛威神，从座而起，偏袒一肩，右膝著地，向薄伽梵，曲躬合掌。白言：‘世尊!惟愿演说如是相类诸佛名号，及本大愿殊胜功德，令诸闻者业障销除，为欲利乐像法转时诸有情故’。
尔时、世尊赞曼殊室利童子言：‘善哉!善哉!曼殊室利!汝以大悲，劝请我说诸佛名号，本愿功德，为拔业障所缠有情，利益安乐像法转时诸有情故。汝今谛听!极善思惟!当为汝说’。
曼殊室利言：‘唯然，愿说!我等乐闻!’
佛告曼殊师利：‘东方去此，过十殑伽沙等佛土，有世界名净琉璃，佛号药师琉璃光如来、应、正等觉，明行圆满、善逝、世间解、无上士、调御丈夫、天人师、佛、薄伽梵。’
‘曼殊室利!彼世尊药师琉璃光如来本行菩萨道时，发十二大愿，令诸有情，所求皆得’。
‘第一大愿：愿我来世，得阿耨多罗三藐三菩提时，自身光明炽然照耀无量无尽无边世界，以三十二大丈夫相，八十随形庄严其身;令一切有情如我无异’。
‘第二大愿：愿我来世得菩提时，身如琉璃，内外明彻，净无瑕秽;光明广大，功德巍巍，身善安住，焰网庄严过于日月;幽冥众生，悉蒙开晓，随意所趣，作诸事业’。
‘第三大愿：愿我来世得菩提时，以无量无边智慧方便，令诸有情皆得无尽所受用物，莫令众生，有所乏少’。
‘ 第四大愿：愿我来世得菩提时，若诸有情行邪道者，悉令安住菩提道中;苦行声闻独觉乘者，皆以大乘而安立’。
‘第五大愿：愿我来世得菩提时，若有无量无边有情，于我法中修行梵行，一切皆令得不缺戒、具三聚戒;设有毁犯，闻我名已还得清净，不堕恶趣!’
‘第六大愿：愿我来世得菩提时，若诸有情，其身下劣，诸根不具，丑陋、顽愚、盲、聋、喑、哑、挛躄、背偻、白癞、颠狂、种种病苦;闻我名已，一切皆得端正黠慧，诸根完具，无诸疾苦’。
‘第七大愿：愿我来世得菩提时，若诸有情众病逼切，无救无归，无医无药，无亲无家，贫穷多苦;我之名号一经其耳，众病悉除，身心安乐，家属资具悉皆丰足，乃至证得无上菩提’。
‘第八大愿：愿我来世得菩提时，若有女人为女百恶之所逼恼，极生厌离，愿舍女身;闻我名已，一切皆得转女成男，具丈夫相，乃至证得无上菩提’。
‘第九大愿：愿我来世得菩提时，令诸有情出魔罥网，解脱一切外道缠缚;若堕种种恶见稠林，皆当引摄置于正见，渐令修习诸菩萨行，速证无上正等菩提!
‘第十大愿：愿我来世得菩提时，若诸有情王法所加，缚录鞭挞，系闭牢狱，或当刑戮，及余无量灾难侮辱，悲愁煎逼，身心受苦;若闻我名，以我福德威神力故，皆得解脱一切忧苦!’
‘第十一大愿：愿我来世得菩提时，若诸有情饥渴所恼，为求食故造诸恶业;得闻我名，专念受持，我当先以上妙饮食饱足其身，后以法味毕竟安乐而建立之’。
‘第十二大愿：愿我来世得菩提时，若诸有情贫无衣服，蚊虻寒热，昼夜逼恼;若闻我名，专念受持，如其所好即得种种上妙衣服，亦得一切宝庄严具，华鬘、涂香，鼓乐众伎，随心所玩，皆令满足’。
‘曼殊室利!是为彼世尊药师琉璃光如来、应、正等觉行菩萨道时，所发十二微妙上愿’。
‘复次、曼殊室利!彼世尊药师琉璃光如来行菩萨道时，所发大愿，及彼佛土功德庄严，我若一劫、若一劫余，说不能尽。然彼佛土，一向清净，无有女人，亦无恶趣，及苦音声;琉璃为地，金绳界道，城、阙、宫、阁，轩、窗、罗网，皆七宝成;亦如西方极乐世界，功德庄严，等无差别。于其国中，有二菩萨摩诃萨：一名日光遍照，二名月光遍照。是彼无量无数菩萨众之上首，次补佛处，悉能持彼世尊药师琉璃光如来正法宝藏。是故曼殊室利!诸有信心善男子、善女人，应当愿生彼佛世界’。
尔时、世尊，复告曼殊室刊童子言：‘曼殊室利!有诸众生，不识善恶，惟怀贪吝，不知布施及施果报，愚痴无智，阙于信根，多聚财宝，勤加守护。见乞者来，其心不喜，设不获已而行施时，如割身肉，深生痛惜。复有无量坚贪有情，积集资财，于其自身尚不受用，何况能与父母、妻子、奴婢作使，及来乞者?彼诸有情，从此命终生饿鬼界，或傍生趣。由昔人间曾得暂闻药师琉璃光如来名故，今在恶趣，暂得忆念彼如来名，即于念时从彼处没，还生人中;得宿命念，畏恶趣苦，不乐欲乐，好行惠施，赞叹施者，一切所有悉无贪惜，渐次尚能以头目手足血肉身分施来求者，况余财物?’
